Masane se entera de que Takayama y Rena alguna vez tuvieron una relación sentimental. Aunque Rena fue considerada previamente como un rival para Witchblade, ella huyó con Witchblade, y el propio Takayama no parece saber los detalles de lo que sucedió después de eso. Por otro lado, Shiori, que ha acelerado su fugitivo, ataca el crucero con Masane. Efecto sobre el usuario al activar Cloneblade. A veces desintegra al propio usuario. Rena estaba analizando tranquilamente el fenómeno.

En un futuro no muy lejano, dos organizaciones están en busca del arma definitiva: la Doji Heavy Industry desarrolla las máquinas más poderosas, mientras que la NSWF intenta crear seres humanos superiores a través de la manipulación genética. Ambas organizaciones intentan desarrollar el "Witchblade", un arma que sólo puede ser manejada por mujeres con grandes cualidades y con capacidad para controlar su poder al máximo. Después de que hayan transcurrido seis años desde el gran terremoto que dejó gran parte del planeta cubierto por agua, Amaha Masane y su hija Naoko deciden mudarse a Tokyo; lo que ellas no sabían es que allí las aguardan los oscuros poderes que encierran los "Witchblade" y un destino cruel e incierto...