Masane, incapaz de alejarse de las ‘palabras impactantes’ que le dijo Segawa, comienza a derramar un afecto excesivo en Rihoko. En ese momento, Wado estaba tratando de fortalecer su posición dentro de la empresa al anunciar el desarrollo de ‘Ultimate Blade’ en Doji Heavy Industries. Además, Nishida comenzó a sentir los límites del proyecto Neogene. Para perseguir a la NSWF, Tozawa obtiene información sobre la crianza de Furumizu, pero…

En un futuro no muy lejano, dos organizaciones están en busca del arma definitiva: la Doji Heavy Industry desarrolla las máquinas más poderosas, mientras que la NSWF intenta crear seres humanos superiores a través de la manipulación genética. Ambas organizaciones intentan desarrollar el "Witchblade", un arma que sólo puede ser manejada por mujeres con grandes cualidades y con capacidad para controlar su poder al máximo. Después de que hayan transcurrido seis años desde el gran terremoto que dejó gran parte del planeta cubierto por agua, Amaha Masane y su hija Naoko deciden mudarse a Tokyo; lo que ellas no sabían es que allí las aguardan los oscuros poderes que encierran los "Witchblade" y un destino cruel e incierto...