Senku trabaja duro para conseguir mano de obra y así estar un paso más cerca de construir su reino de ciencia. Mientras tanto, aparece en la aldea un misterioso personaje.

Taiju está enamorado de una linda estudiante llamada Yuzuriha y, cuando pretende confesarse, una luz enceguecedora de origen desconocido provoca que todos los seres humanos sin excepciones se conviertan en piedra. Como consecuencia, la sociedad y la civilización se desmorona. Pasan miles de años y Taiju finalmente logra liberarse de la petrificación gracias a su amigo Senku, el cual pudo liberarse medio año antes. Gracias a eso, ahora sabe que están en el 5 de Octubre del año 5738... 3700 años después de la petrificación de la raza humana.