Emily se preocupa por una chica, Addison, que parece ser una nueva versión de Ali de la escuela secundaria, y que se puede conectar a un enemigo familiar. Mientras tanto, Spencer consigue tener un enfrentamiento con su madre por tener guardado durante tanto tiempo secretos relacionados con su familia. Aria le confía a Holden los problemas actuales que tiene con Ezra. Spencer se convierte en una detective en busca de ayuda. Y Jenna causa aún más problemas cuando regresa y dice también ser una víctima de Noel Kahn.

La trama sigue la vida de cuatro amigas (Spencer, Hanna, Aria y Emily) tras la desaparición de Alison, la quinta del grupo. Un año después comienzan a recibir mensajes anónimos de alguien que se hace llamar A. Los mensajes amenazan con rebelar sus secretos, incluso algunos que sólo Alison sabía.