Momentos después de donde se quedó la quinta temporada, Aria, Emily, Hanna, Spencer y Mona están atrapadas en el exterior de la casa de muñecas de Charles, con ningún sitio al que ir y debiendo ahora lidiar con un torturador enfadado. Justo cuando las 'liars' pensaban que Charles no podía empeorar, sus juegos dan un giro más demente y oscuro. Mientras las chicas luchan por sobrevivir, las piezas del puzzle de la historia de Charles comienzan a juntarse. Mientras tanto, Ezra, Caleb y Toby continúan luchando para encontrar a las chicas con o sin la ayuda del Departamento de Policía de Rosewood.

La trama sigue la vida de cuatro amigas (Spencer, Hanna, Aria y Emily) tras la desaparición de Alison, la quinta del grupo. Un año después comienzan a recibir mensajes anónimos de alguien que se hace llamar A. Los mensajes amenazan con rebelar sus secretos, incluso algunos que sólo Alison sabía.