Los alumnos de ultimo año se centran en sus futuras carreras universitarias y sienten las grandes presiones que vienen junto con ellas, y Aria, Emily, Hanna y Spencer no son diferentes. Con una carta de aceptación, Aria tiene que apretarse el cinturón para mejorar sus calificaciones y en busca de ayuda acude a Andrew por algo de tutoría. También con la ansiedad de ser aceptada en una universidad, Spencer decide tomarse un descanso y ayuda a Johnny con un nuevo proyecto. Hanna está haciendo muy bien en sus cartas de aceptaciones para la universidad, pero descubre que ha sido rechazada para la ayuda financiera y recurre a su padre por ayuda. Mientras tanto, Aria y las chicas muestran sus preocupaciones sobre Mike, las cuales aumentan después de un incidente en una donación de sangre de la escuela.

La trama sigue la vida de cuatro amigas (Spencer, Hanna, Aria y Emily) tras la desaparición de Alison, la quinta del grupo. Un año después comienzan a recibir mensajes anónimos de alguien que se hace llamar A. Los mensajes amenazan con rebelar sus secretos, incluso algunos que sólo Alison sabía.