Los secretos son difíciles de esconder, especialmente cuando los escondes de aquella persona a la que amas. Spencer se encuentra en la búsqueda de la laptop desaparecida de Mona con la ayuda de Caleb pero hacia donde esa búsqueda los guía podría cruzar la 'linea de aprobación' de Toby. Aria intenta tener el coraje de confesar a Ezra su mentira cuando se ve desviada en una búsqueda inútil. Hanna se encuentra atrapada en el medio cuando tiene que proteger el secreto de Ashley del Pastor Ted quien regresa con grandes noticias. Mientras tanto, Emily tiene que lidiar con las molestas sugerencias de Talia en el trabajo, al mismo tiempo tiene que luchar con el termino de su relación con Paige.

La trama sigue la vida de cuatro amigas (Spencer, Hanna, Aria y Emily) tras la desaparición de Alison, la quinta del grupo. Un año después comienzan a recibir mensajes anónimos de alguien que se hace llamar A. Los mensajes amenazan con rebelar sus secretos, incluso algunos que sólo Alison sabía.