debido a la mudanza de Chuck Lester (antiguo monitor escolar) a Grecia, la Escuela Primaria Lindbergh decide escoger al nuevo monitor, Carl soñaba con ser monitor pero no pudo lograrlo, el primero en ser escogido fue Jimmy Neutrón, al principio detestaba la idea, pero cuando el director le dijo que Einstein fue monitor, y el miedo que puso en algunos, hizo que cambiara de idea, pero abuso de su poder en demasia, renunciando a su cargo, pero no lo dejaron, entonces dejo que lo despidieran.

La serie sigue las aventuras de Jimmy, su fiel perro Goddard y sus amigos y familia en Retroville, Texas. Para hacer su vida un poco más interesante, Jimmy se la pasa inventando aparatos y cosas increíbles, pero éstas suelen fallar a menudo; y debe salvar su ciudad de las consecuencias. No obstante, tiene también que enfrentar los problemas de un pre-adolescente común, como lidiar con abusones en la escuela y enamorarse.