Siete meses después de la llegada de la 2nd Mass a Charleston, Tom ha sido elegido para un cargo político y la resistencia continúa combatiendo a los invasores alienígenas. La decisión de Tom de crear una alianza con los Skitters rebeldes crea tensión y las sospechas sobre un espía dentro de la resistencia aumentan. Mientras tanto, Hal lucha contra pesadillas tan reales que tiene dificultades para saber si está dormido o despierto y Anne y Tom se preparan para la llegada de su bebé.

Falling Skies cuenta la historia de las secuelas de una invasión alienígena que, además de neutralizar toda la tecnología avanzada y la generación de electricidad, elimina a la gran mayoría de las fuerzas militares de todos los países en un tiempo corto. Se infiere que cerca del 90% de la población mundial fue eliminada en la primera ola del ataque. La historia comienza 6 meses después de la invasión.