Con el incidente del ladrón de bragas ya erosionando la confianza de la clase D, Horikita descubre que le han robado su tarjeta de líder. Mientras intentan averiguar quién lo ha hecho, el campamento base se sume en el caos debido a un incendio intencionado.

Kiyotaka Ayanokouji acaba de entrar en la Academia Tokyo Koudo Ikusei, de la cual se dice que el 100% de sus estudiantes acaban yendo a la universidad o encontrando un buen trabajo. Sin embargo nuestro protagonista acaba en la Clase 1-D, donde la escuela pone a todos los alumnos con problemas. Y lo que es más, cada mes la escuela otorga a los estudiantes puntos por valor de 100.000 yenes, y las clases emplean un sistema por el cual se puede hablar, dormir e incluso molestar a los compañeros durante las clases.